疯狂动物园的BOSS任务系统是游戏的核心玩法之一，目前游戏中共有9张地图，每张地图包含3种BOSS动物，总计27个BOSS任务。触发BOSS任务的条件是每完成35个普通任务后随机出现一次，但游戏内不会显示已完成的任务计数，因此玩家需要持续刷普通任务才能遇到BOSS任务。需BOSS任务不会重复出现，这意味着每个BOSS动物只需驯服一次即可完成对应任务。
稀树草原作为初始地图，包含暗黑野牛、特洛伊斑马、机械秃鹰和油炸狮等BOSS动物。其中暗黑野牛需要骑乘同一只野牛连续跑700米，而机械秃鹰则需在1400米后的中间大石头上才能遇到。丛林地图的BOSS任务包括恐龙犀牛、三嘴鸟和鸭嘴河马，后者要求骑乘同一只河马跑1600米且河马仅在2000米后的水塘区域出现。山脉地图的BOSS动物如战斗熊、罗宾汉鹰和蒸汽朋克，分别需要骑乘老鹰跑2000米或耗牛撞击10只动物。
后续地图如澳洲、极地、侏罗纪公园和奥林匹斯山脉也各有3种BOSS动物，例如奥林匹斯山脉的三头凤凰需用狮鹫在一局内吃掉三只凤凰。驯服BOSS动物的难度较高，不仅驯服时间较长，地图场景还会根据动物特性增强障碍设计。例如罗宾汉鹰任务要求玩家从跑道边缘的灌木丛起飞并落在最远的山峰上，操作容错率较低。
关于BOSS任务的触发机制，部分资料显示每完成（30+5已完成BOSS任务数）个普通任务后才会出现新BOSS任务。进入任务地图的方式有两种：一是在接到任务后直接探索地图，二是在失败时点击任务描述旁的骷髅头图标重新进入。成功驯服BOSS后会解锁对应图鉴，但不会重复计数。
综合现有信息，疯狂动物园确实设计了27个BOSS任务，覆盖全部9张地图。玩家需通过持续完成普通任务来逐步解锁，并针对不同BOSS的驯服条件制定策略。由于部分BOSS动物出现位置或操作要求较为特殊，建议提前查阅具体区域的攻略以提高效率。
